افرادی که خالکوبی انجام می دهند ممکن است زمانی که می خواهند ام.آر.آی انجام دهند دچار مشکل شوند.البته مشکل خیلی شایعی نیست ولی ممکن است پیش بیاید که افرادی که خالکوبی دارند در دستگاه ام.آر.آی دچار سوزش و خارش در قسمت خالکوبی شوند که علت کاملا مشخصی ندارد ولی به خاطر املاح فلزات سنگینی که در رنگدانه ها به کار رفته است می تواند به وجود بیاید.گاهی اوقات امکان دارد که خالکوبی باعث شود که تفسیر ام.آر.آی دچار مشکل شود.مثلا کسی بخواهد از ناحیه چشمش ام.آر.آی انجام دهد و خط چشم خالکوبی کرده باشد این مسئله باعث می شود در تفسیر ام.آر.آی مشکل ایجاد شود.
