غذایی که می خوریم از طریق لوله ای به نام مری وارد معده می شود . هضم غذا در معده توسط اسید و شیره ی معده آغاز می گردد . دیواره ی معده به دلیل تماس مداوم با اسید و شیره ی معده در مقابل اثرات مخرب آن ها مقاوم شده و بالعکس دیواره ی مری به دلیل این که به طور معمول در معرض تماس با اسید و شیره ی معده نیست ، دفاع مناسبی هم در برابر این عوامل ندارد . در حالت طبیعی ، دریچه ای به نام دریچه ی مری بین مری و معده قرار دارد که اجازه می دهد غذا از مری وارد معده شود . ولی از بازگشت غذا و شیره ی معده به مری جلوگیری می کند . اگر دریچه ی مری ، وظیفه ی خود را به درستی انجام ندهد ، یعنی به خوبی بسته نشود یا بی موقع باز شود ، اسید و شیره ی معده به داخل مری بر می گردند . ، دیواره ی مری در برابر اسید و شیره ی معده آسیب پذیر است . بنا بر این در شرایطی که دریچه ی مری کار خود را به درستی انجام ندهد ، بازگشت اسید و شیره ی معده به داخل مری باعث آزردگی مری می گردد . به بازگشت غیر عادی اسید و شیره ی معده به داخل مری و آزرده شدن مری در اثر تماس با این عوامل ، بیماری ریفلاکس معده به مری یا اصطلاحا ریفلاکس گفته می شود .
